Quantification de pixels sur une ligne – automatisation

Bonjour,

Dans le cadre de mes recherche, je distingue une relocalisation partielle de mon signal de fluorescence dans le cytoplasme comparativement à un marquage usuel à la membrane ou sur une endomembrane. Je cherche donc à quantifier ce “bruit de fond” cytoplasmique en utilisant des lignes et en mesurant l’intensité des pixels le long de cette ligne. J’utilise d’ordinaire ImageJ pour cela, cependant je n’arrive pas à compiler les courbes obtenues.

Je voulais savoir comment Icy pourrait répondre à mon petit souci et s’il était possible de créer un algorithme personnalisé pour automatiser les tâches à effectuer si celles-ci se révèlent nombreuses.

Merci pour votre aide.

bien cordialement,

Julien Saint-Pol, Ph.D

Maître de conférences – Université d’Artois, Lens